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Il fascino di X sta, oltre che nella trama, nei suoi personaggi, ai quali le autrici dedicano grande spazio, ripercorrendone il passato e offrendone una caratterizzazione completa e accurata. Difatti, nonostante i protagonisti di X siano molti, nessuno di loro viene posto in secondo piano, così che la distinzione fra personaggi principali e personaggi secondari è pressoché assente.
Due sono gli schieramenti in cui sono divisi:

Draghi del Cielo & Draghi della Terra

Queste sono le fazioni che si affronteranno nell'Apocalisse. Gli appartenenti ad esse sono già stati decisi dal destino. Solo Kamui ha il potere di scegliere con chi schierarsi dando inizio alla fine del mondo. Altri personaggi che rivestono un ruolo decisamente importante sono la Principessa sognatrice Hinoto e sua sorella minore Kanoe schierate rispettivamente con i Draghi del Cielo e con i Draghi della Terra.
Non va assolutamente dimenticata Kotori, la quale risulta protagonista delle scene più drammatiche, rimanendo forse il personaggio più enigmatico della storia.

	Kamui Fuma Kotori Subaru Seishirou Sorata Yuto Arashi Satsuki Karen Kakyou Seiichirou Nataku Yuzuriha Kusanagi Hinoto Kanoe